Uni Wien:Algorithmische Bioinformatik VU (Arndt von Haeseler)

Daten[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Vortragende	Arndt von Haeseler, Stefan Badelt, Heiko Andreas Schmidt
ECTS	6,00 / 4,00
Sprache	English
Links	ufind:053520 , Homepage

Zuordnungen
Master Bioinformatik	Modul BIOINF02 Algorithmische Bioinformatik (Pflichtfach)
Master Data Science	Modul Specialisation (Gebundenes Wahlfach)

Inhalt[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Es werden verschiedene Algorithmen aus dem Bereichen Mathematik, Chemie und Biologie vorgestellt. Die ganze Vorlesung orientiert sich an dem Buch Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach von Compeau und Pevzner.

Algorithmen: Randomisierte Algorithmen, Graphen-Algorithmen, Brute Force Algorithmen, Dynamische Programmierung, Combinatorische Algorithmen, Evolutionaere Baum-Rekonstruktion, Clustering Algorithmen, Cominatorial Pattern Matching, Hidden Markov Modelle und Methoden der Computational Proteomics.

Ablauf[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Es gibt jede Woche 2 Termine. Einmal Vorlesung und einmal Übung. Für jede Übung hat man im Schnitt 8 Tage Zeit. Theoretisch wollten die Lehrenden die Übungen noch am Tag der Vorlesung auf Moodle hochladen. In der Realtiät war es meinsten (nicht immer) 1-2 Tage nach der Vorlesung. Abgabe der Übung über Moodle um Mitternacht vor der Übung.

Grundsätzlich gilt Anwesendheitspflicht. Es wird aber so gut wie nie kontrolliert und wenn schon, ist es auch nicht tragisch wenn man mal fehlt.

Benötigte/Empfehlenswerte Vorkenntnisse[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Für Progammiereinsteiger:innen kann es sehr Überwältigend sein. Thematisch sind keine Vorkenntnisse notwendig.

Vortrag[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Vorlesung ist interessant. Ab und an auch etwas langwierig. Kommt auf die vortragende Person an. Die Vorlesung bringt auch nicht immer einen Mehrwert, da mit dem Buch die Übungen auch gelöst werden können.

Übungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Zu den wöchentlichen Übungen muss ein Protokoll erstellt werden. Jede Vortragende Person erwartet hier etwas anderes. In den Übungen selbst werden die Beispiele von den Studierenden in der Regel auf Englisch präsentiert. Jede:r Studierende muss mind. 1 mal dran gewesen sein.