TU Wien:Bioinformatik VO (Mach)/Prüfung 2011-12-15

Der Großteil der Fragen ist schon einmal bei einer Prüfung gekommen!

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10 Fragen, 120min Zeit

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• 1. Laplace Wahrscheinlichkeit (Augenzahl 1,2) bei 6-seitigen Würfel und Erwartungswert (bei 10 Würfen) ausrechnen.

• 2. Zeichne die Verteilungen von 2 Populationen A und B und trage Signifikanzniveau alpha ein. Markiere die Flächen der Fehler 1. und 2. Art.

• 3. Nennen Sie die drei wesentlichen Kategorien bzw. Arten von bioinformatischen Datenbanken und nennen Sie ein Beispiel der darin enthaltenen Informationen

(KEINE Bioinformatik Server nenen!)

• • A:
  • B:
  • C:

• 4. MC Frage zur Irrtumswahrscheinlichkeit (Signifikanzniveau).
  • a) p<0,05 bedeutet nicht signifikantes Ereignis
  • b) p>0,05 bedeutet ein signifikantes Ereignis
  • c) p<=0,05 bedeutet ein signifikantes Ereignis
  • d) p<=0,01 bedeutet ein sehr signifikantes Ereignis

• 5. Was sind SNPs, wofür verwendet?

• 6. Was ist Comparative Genomics? Wie/wofür anwendbar? Nenne 5 Modellorganismen.

• 7. Hauptproblem automatische Genomannotierung

• 8. Model of Evolution? 10 free parameters for alignment? Name a constrained and a unconstrained model of evolution.

• 9. Explain homoplasy in molecular data. Simulate an example nucleotide alignment

(minimum 3 steps of series of evolutionary transformations t0ancestral -> t1 -> t2derived) showing homologous and homoplasious characters.

• 10. What is the law of parsimony and parsimony (minimum evolution). Explain how it is applied in phylogentic reconstruction.