TU Wien:Bioinformatik VO (Mach)/Prüfung 2013-04-18

Folgende 10 fragen/themengebiete kamen zur Prüfung (aus dem Gedächtnis wiedergegeben):

1a) Statistische signifikanz (p-wert, unterschied zwischen signifikanz und relevanz)

1b) MC: Aussagen zu nullhypothese annehmen/verwerfen und fehler 1.art/2.art

2) levensthein-distanz 2er sequenzen ausrechnen (mit nxm matrix) + backtracking

3) zusammenhang zwischen genomics, proteomics und transcriptomics erklaeren. Welche informationen erhaelt man bei was (bzw. Welche nicht)?

4) was traegt die bioinformatik bei der genomannotierung bei und welche probleme gibt es? Beschreiben sie die methoden und probleme! ( ich nehme mal an methoden zur annotierung)

5) was ist die rolle von KEGG in der bioinformatischen metagenomanalyse? Worin unterscheidet sie sich von anderen datenbanken?

6) Beschreiben sie kurz den ablauf von der Probenentnahme bis zur sequenzierung (bei der metagenomik). Welche bioinformatischen analysen kann man auf den erhaltenen sequenzen durchfuehren?

7) definition of genetic distance + how can it be estimated?

8) homologie, homoplasie + wie kann man beide unterscheiden?

9) define clade and cladistic!

10) welche parameter bei evolutionären modellen gibt es?